équipe V.Blasco-Baque
InCOMM: Microbiote oral – facteur de risque du Phénotype cardio-métabolique
Notre équipe porte sur une recherche clinique translationnelle permettant de comprendre les mécanismes moléculaires à travers lesquelles le microbiote humain oral et intestinal régule les maladies cardio-métaboliques chez l’homme.
L’Équipe
Vincent BLASCO-BAQUE
Rémy BURCELIN
Christophe HEYMES
Vincent AZALBERT
Pascale LOUBIERES
Matthieu MINTY
Charlotte THOMAS
Jiuwen SUN
Sylvie Lê
Manon Saucourt
Pierre Brinas
Maxime Louis
Marie Georgealin-Gurgel
Thibault Canceill
Geraud Tuyeras
Franck Diemer
Swann DIEMER
Dysbiose microbienne, hétérogénéité des dépôts adipeux et dysfonction cardiométabolique
Coordinateurs : Vincent Blasco-Baque, Rémy Burcelin
Coordinateurs associés : Géraud Tuyeras, Pierre Brinas, Jiuwen Sun
Nos objectifs sont la création et l’analyse de banques de données larges échelles (métagénomiques, transcriptomiques, métabolomiques) de dépôts adipeux et de microbiomes tissulaires et buccaux issus de cohortes humaines et murines (dont des lignés de souris axéniques colonisées par des microbiotes humains) dans des contextes d’obésité et de vieillissement en fonction du sexe. Les liens avec les données cliniques/biologiques sont analysés par des stratégies « machine learning » (développement de nouveaux algorithmes) afin d’extraire l’information classifiant et/ou prédictive des phénotypes cardiométaboliques et de proposer de nouvelles relations moléculaires entre les bactéries tissulaires et les cellules des dépôts adipeux.
Dynamique et adaptation de l’axe microbiote/dépôts adipeux:
Flexibilité métabolique et PRE-PROBIOTIQUE
Coordinateur : Christophe Heymes
A l’aide d’une approche nutritionnelle (basée sur l’utilisation d’un prébiotique), les objectifs au cours du développement de l’obésité/diabète, sont 1) d’étudier les dysbioses intestinale et tissulaires (tissus adipeux et cœur) ; 2) d’étudier les effets du Polydextrose (prébiotique) sur ces dysbioses et l’impact sur la dysfonction cardiaque ; 3) d’identifier de nouveaux probiotiques et métabolites bactériens responsables des effets observés ; 4) d’identifier des mécanismes moléculaires (peptides, protéines sécrétes par l’intestin et/ou le tissu adipeux) médiant en partie les effets observés.
Identifier les acteurs moléculaires du microbiote sur les maladies cardio-métaboliques dans des cohortes humaines
Coordinateurs : Vincent Blasco-Baque
Nos objectifs sont la création et l’analyse de banques de données larges échelles (OMICs cliniques, métagénomiques, transcriptomiques, métabolomiques) de microbiotes tissulaires et buccaux issus des cohortes humaines dans le contexte des maladies cardio-métaboliques. Nous réaliserons aussi une bio-banque de tissus et de microbiote afin de réaliser les liens avec les données cliniques, biologiques et métagénomiques.
BuccoBaria Coordinateurs associés : Géraud Tuyeras, Pierre Brinas, Sylvie Lê
BuccoViccardio Coordinateurs associés : Thibault Canceill, Matthieu Minty
Bucco Cœur Coordinateurs associés : Matthieu Minty
MicroValv Coordinateurs associés : Jacques Amar, Jean Porterie
BuccoNash Coordinateurs associés : Matthieu Minty
BuccoDiabéto Coordinateurs associés : Charlotte Thomas, Maxime Luis
NephroBiota Coordinateurs associés : Sylvie Lê
Granulobiota Coordinateurs associés : Franck Diemer, Marie Georgelin- Gurgel, Manon Saucourt
Parobiota Coordinateurs associés : Charlotte Thomas, Sylvie Lê
Coordinateurs techniques associés sur l’ensemble des projets : Vincent Azalbert, Pascale Loubières, Swann Diemer
BetinFLAM
Coordinateur : Rémy Burcelin
Le projet Betinflam est une collaboration entre l’équipe Dynamix de l’Inserm Toulouse et l’entreprise Cell-easy à Toulouse. L’objectif est de mettre au point un procédé de mesure de l’impact de molécules bactériennes sur le développement de la sénescence d’une lignée humaine de cellules Béta d’îlot de Langerhans ». Ce procédé permettra de tester l’impact de stratégies thérapeutiques basées sur le microbiote intestinal et tissulaire, notamment dans le domaine du cancer et du vieillissement.
Bactage
Vieillissement, pathologies musculaires et dysbiose intestinale : Validation d’une approche nutritionnelle par un prébiotique, le Polydextrose, et des bactéries amplifiées par ce composé comme traitements préventifs ou thérapeutiques.
Coordinateur : Christophe Heymes
Le projet BactAge est une collaboration entre les équipes toulousaines InCOMM de l’I2MC, METEBOLINK de RESTORE et l’entreprise Lallemand SAS à Blagnac. L’objectif général est de valider l’hypothèse selon laquelle le traitement de la dysbiose du microbiote intestinal, à l’aide d’un prébiotique tel le Polydextrose, retarderait le développement de la sarcopénie et de l’IC associées à l’âge.
THINKGUT
Coordinateur : Rémy Burcelin
ThinkGut est un projet de recherche mené par l’Institut d’Investigació Biomèdica de Girona Dr. Josep Trueta (IDIBGI) en association avec l’équipe InCOMM de l’I2MC et la PME Enterosys SAS., qui étudie le rôle du microbiote intestinal dans les troubles neurocognitifs associés à l’obésité et au vieillissement. Ce projet a été co-financé à 65% par le Fond Européen de Développement Régional (FEDER) via le programme Interreg V-A Spain-France-Andorra (POCTEFA 2014-2020).
Plus d’infos : https://thinkgut.eu/fr/
publications RECENTES
Obesity of mice lacking VAP-1/SSAO by Aoc3 gene deletion is reproduced in mice expressing a mutated vascular adhesion protein-1 (VAP-1) devoid of amine oxidase activity, Jargaud V, Bour S, Tercé F, Collet X, Valet P, Bouloumié A, Guillemot JC, Mauriège P, Jalkanen S, Stolen C, Salmi M, Smith DJ, Carpéné C. J Physiol Biochem. 2021. Pubmed
Detection of representative variables in complex systems wtih interpretable rules using Core-Clusters. Champion, C., A. C. Brunet, R. Burcelin, J. M. loubes and l. Risser. Algorithms 2021. Pubmed
Molecular phenomics and metagenomics of hepatic steatosis in non-diabetic obese women. Hoyles, L., J. M. Fernandez-Real, M. Federici, M. Serino, J. Abbott, J. Charpentier, C. Heymes, J. L. Luque, E. Anthony, R. H. Barton, J. Chilloux, A. Myridakis, L. Martinez-Gili, J. M. Moreno-Navarrete, F. Benhamed, V. Azalbert, V. Blasco-Baque, J. Puig, G. Xifra, W. Ricart, C. Tomlinson, M. Woodbridge, M. Cardellini, F. Davato, I. Cardolini, O. Porzio, P. Gentileschi, F. Lopez, F. Foufelle, S. A. Butcher, E. Holmes, J. K. Nicholson, C. Postic, R. Burcelin and M. E. Dumas. Nat Med. 2018. Pubmed
Lobular architecture of human adipose tissue defines the niche and fate of progenitor cells. Estève D, Boulet N, Belles C, Zakaroff-Girard A, Decaunes P, Briot A, Veeranagouda Y, Didier M, Remaury A, Guillemot JC, Ledoux S, Dani C, Bouloumié A, Galitzky J. Nat Commun. 2019. Pubmed
Senescence Alters PPARγ (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma)-Dependent Fatty Acid Handling in Human Adipose Tissue Microvascular Endothelial Cells and Favors Inflammation. Briot A, Decaunes P, Volat F, Belles C, Coupaye M, Ledoux S, Bouloumié A. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2018. Pubmed
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