GENOMIQUE
& transcriptomique
Le plateau propose des outils d’analyse du génome et du transcriptome, ainsi que l’expertise pour la réalisation des projets NGS (RNAseq, Single cell et Spatiale omiques…)
ÉQUIPE
Expertises
ÉQUIPEMENTS
RÉSERVATIONS/CONTACT
L’Équipe

Emeline LHUILLIER

Rachel Fourdin
COMITE DE PILOTAGE
Anaïs BRIOT | Email me |
Jean-Philippe PRADERE | Email me |
Emmanuelle ARNAUD | Email me |
Aline MAIRAL | Email me |
Alexandra MONTAGNER | Email me |
Eric LACAZETTE | Email me |
Gaëtan CHICANNE | Email me |
Audrey CASEMAYOU | Email me |
Adeline CHAUBET | Email me |
Constandina ARVANITIS | Email me |
Carine VALLE | Email me |
Alexia ZAKAROFF-GIRARD | Email me |
Sabrina BENAOUADI | Email me |
Thibaut DUPARC | Email me |
Nicole MALET | Email me |
EXPERTISES

CONTROLE QUALITE ADN / ARN
Mise à disposition d’instruments (Nanodrop, Fragment Analyzer…), formation à leur utilisation ou réalisation des contrôles, aide à l’interprétation des données.

QPCR / DDPCR
Mise à disposition de plusieurs instruments: qPCR 96 ou 384 puits, QX200.
Formation à leur utilisation et accompagnement dans le design des projets selon les applications.

REALISATION DE LIBRAIRIES NGS
RNAseq, ChIPseq, WGS… : accompagnement dans le design des projets, construction des librairies, coordination avec les plateformes de séquençage et d’analyses bioinfo.

SINGLE CELL ET SPATIALES OMICS
Prise en charge de projets en interaction étroite avec l’équipe de recherche (collaboration, partenariat) de single cell 3′ RNAseq, CITE-seq, 5’VDJ, cell hashing, etc…
ÉQUIPEMENTS
Voici la liste exhaustive des équipements proposés par le plateau GeT-Santé…)
réservations & CONTACT
Planning de réservation pour les instruments accessibles en autonomie après formation et accréditation
Une question ?
Actualités
Publication d’un article de l’équipe AdipoLive (D. Langin/P. Gourdy) dans Cell Metabolism
Une nouvelle étude dirigée par le Dr Etienne...
Publication d’un article de l’équipe MetaDiab (C. Moro) dans Science Advances
Carper et al. here demonstrates that reduced...
Publication d’un article de l’équipe MetaDiab (C. Moro) dans Cell reports
GDF15 is dispensable for the insulin-sensitizing...
publications RECENTES
Tumor-associated high endothelial venules mediate lymphocyte entry into tumors and predict response to PD-1 plus CTLA-4 combination immunotherapy. Assia Asrir, Claire Tardiveau, Juliette Coudert, Robin Laffont, Lucas Blanchard, Elisabeth Bellard, Krystle Veerman, Sarah Bettini, Fanny Lafouresse, Estefania Vina, Dorian Tarroux, Severine Roy, Isabelle Girault, Irma Molinaro, Frédéric Martins, Jean-Yves Scoazec, Nathalie Ortega, Caroline Robert, Jean-Philippe Girard. Cancer cell, 2022. Pubmed
Tamoxifen Accelerates Endothelial Healing by Targeting ERα in Smooth Muscle Cell. Zahreddine R, Davezac M, Smirnova NF, Buscato M, Lhuillier E, Lupieri A, Solinhac R, Vinel A, Vessieres E, Henrion D, Renault M-A, Gadeau A-P, Flouriot G, Lenfant F, Laffargue M, Metivier R, Arnal J-F, Fontaine C.
Circulation Research, 2020. Pubmed
Single-cell RNA sequencing unveils the shared and the distinct cytotoxic hallmarks of human TCRVδ1 and TCRVδ2 γδ T lymphocytes. Pizzolato G, Kaminski H, Tosolini M, Franchini D-M, Pont F, Martins F, Valle C, Labourdette D, Cadot S, Quillet-Mary A, Poupot M, Laurent C, Ysebaert L, Meraviglia S, Dieli F, Merville P, Milpied P, Déchanet-Merville J, Fournié J-J. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019. Pubmed
Single-Cell Analysis Reveals Heterogeneity of High Endothelial Venules and Different Regulation of Genes Controlling Lymphocyte Entry to Lymph Nodes. Veerman K, Tardiveau C, Martins F, Coudert J, Girard J-P. Cell Reports, 2019. Pubmed
Niacin induces miR-502-3p expression which impairs insulin sensitivity in human adipocytes. Montastier E, Beuzelin D, Martins F, Mir L, Marqués MA, Thalamas C, Iacovoni J, Langin D, Viguerie N. Int J Obes (Lond). 2018. Pubmed
Caloric Restriction and Diet-Induced Weight Loss Do Not Induce Browning of Human Subcutaneous White Adipose Tissue in Women and Men with Obesity. Barquissau V, Léger B, Beuzelin D, Martins F, Amri EZ, Pisani DF, Saris WHM, Astrup A, Maoret JJ, Iacovoni J, Déjean S, Moro C, Viguerie N, Langin D. Cell Rep. 2018. Pubmed


Inserm/UPS UMR 1297 - I2MC Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires
1 avenue Jean Poulhès - BP 84225 - 31432 Toulouse Cedex 4
Tél. : 05 61 32 56 00
Horaires
Du lundi au vendredi
8h30 - 12h30 / 13h45 -16h45