équipe A. Bouloumié / R. Burcelin

DINAMIX: Tissu adipeux, microbiote et flexibilité cardiométabolique

Notre recherche propose une approche intégrée et pluridisciplinaire des mécanismes d’adaptation métabolique dans le contexte du vieillissement naturel et accéléré par l’obésité/diabète, basée sur le concept original du rôle déterminant de l’axe microbiote/dépôts adipeux dans la flexibilité cardio-métabolique.

L’Équipe

 
Tous / AllResponsableChercheurs et enseignants chercheursCliniciensPost-doctorantsÉtudiantsITA
Responsable d'équipe

Anne BOULOUMIE-DIEHL

Co-Responsable d'équipe / DR1

Rémy BURCELIN

CHERCHEUSE

Anaïs BRIOT

CHERCHEUR

Christian CARPENE

CHERCHEUR

Xavier COLLET

CHERCHEUR

Jean GALITZKY

CHERCHEUR

Christophe HEYMES

CLINICIEN

Jacques AMAR

CLINICIEN

Vincent BLASCO-BAQUE

Post-doctorante

Nathalie BOULET

DOCTORANT

Alex AUPETIT

CLINICIEN - DOCTORANT

Matthieu MINTY

CLINICIEN - DOCTORANT

Charlotte THOMAS

Technicien de recherche

Vincent AZALBERT

Assitante Ingénieur

Pauline DECAUNES BESSEDE

Assitant Ingénieur

Albéric GERMAIN

Adjoint technique

Pascale LOUBIERES

Ingénieur

Joao PIRAQUIVE

Assitante Ingénieur

Jiuwen SUN

PhD, IE, Responsable opérationnel du plateau de cytométrie

Alexia ZAKAROFF-GIRARD

Responsable d'équipe

Anne BOULOUMIE-DIEHL

PhD, HDR, Directrice de recherche INSERM, Responsable d’équipe

Cheminement de carrière
Doctorat en pharmacologie, directeur M. Lafontan, Université P Sabatier, Toulouse (1994); Post-doc, Institut cardiovasculaire (R. Busse), Francfort, Allemagne (1994-1998); CRCN INSERM U598 (1998-2001); Prix Kovalevskaja, Francfort, Allemagne (2002-2006); HDR, Prix AVENIR, I2MR, Toulouse (2007-2011); Depuis 2012, Responsable équipe INSERM, I2MC.

Domaine d’expertise  
Tissu adipeux, progéniteurs, cellules immunitaires, cellules endothéliales, adipogenèse, inflammation, fibrose, sénescence, vieillissement, obésité.

Co-Responsable d'équipe / DR1

Rémy BURCELIN

PhD, Directeur de recherche classe 1 INSERM, Co-responsable d’équipe

Cheminement de carrière
Doctorat d’endocrinologie Université Paris VI (1992) ;  Postdoc New York A. Einstein college or medicine (1993-1995) ;  Professeur Assistant, Université Lausanne (1995-2001) ;  Professeur des Universités, Toulouse (2001) ; Directeur de Recherche INSERM à l’I2MC (2008-présent).

Domaine d’expertise  
Physiologie animale, incrétines, métagénome, métabolisme énergétique, maladies métaboliques et complications hépato-cardiovasculaires.

CHERCHEUSE

Anaïs BRIOT

PhD, CRCN Chargée de Recherche INSERM

Cheminement de carrière
Doctorat en Physiopathologie moléculaire, cellulaire et intégrée, Directeur A Hovnanian (2009) ; Post-Doc Laboratoire de L. Iruela-Arispe, UCLA, USA (2010-2015) ; Depuis 2016, CRCN INSERM Equipe Bouloumié, I2MC, Toulouse.

Domaine d’expertise  
Biologie vasculaire, biologie cellulaire, cellules endothéliales, tissu adipeux, inflammation, vieillissement, sénescence.

CHERCHEUR

Christian CARPENE

PhD, CRHC (Chargé de recherche hors classe) INSERM

Cheminement de carrière
Christian Carpéné a obtenu son doctorat d’Etat Es-Sciences Naturelles à l’Université de Toulouse, en 1994. De 1979 à 1982, il a travaillé comme pré- et post-doctorant dans le domaine de la pharmacologie adrénergique et, depuis 1983 il est Chargé de Recherche à l’INSERM, à Toulouse.

Domaine d’expertise  
Effets biologiques de composés pharmacologiques, hormonaux et nutritionnels (polyphenols, amines alimentaires) sur les fonctions métaboliques et endocrines des adipocytes.

CHERCHEUR

Xavier COLLET

PhD, HDR, Directeur de recherche INSERM

Cheminement de carrière
Doctorat en Biochimie (1988), Post-Doc laboratoire de C. Fielding (1988-1991), Séjour sabbatique : Columbia University, Department of Medecine, New-York, (A. Tall).  Depuis 2021, DR INSERM,  Equipe Bouloumié, I2MC, Toulouse. Directeur du CREFRE (Juillet 2020), Directeur de la SFR-BMT (depuis 2011), Co-directeur de Génotoul (depuis 2011).

Domaine d’expertise  
Métabolisme des lipoprotéines, lipides, cholesterol,  absorption intestinale des lipides, microbiote.

CHERCHEUR

Jean GALITZKY

PhD, CRCH (Chargé de recherche hors classe) INSERM

Cheminement de carrière
Doctorat en pharmacologie moléculaire, directeur M Lafontan, Université P Sabatier, Toulouse (1989);  Post-doc, Karolinska Institute , laboratoire P.Arner, Stockholm, Suède (1989); Depuis 1990, Chercheur INSERM; Depuis 2007, Equipe AVENIR/Bouloumié, I2MC, Toulouse, France.

Domaine d’expertise  
Tissu adipeux, progéniteur, adipogenèse, fibrose, obésité, microdialyse.

CHERCHEUR

Christophe HEYMES

PhD, DR2 (Directeur de recherche) INSERM

Cheminement de carrière
Doctorat en Physiologie et pharmacologie membranaires, Directeur B. Swynghedauw (1997) ; Post-Doc Laboratoire du Pr. Ajay M. Shah, Kings College of London, UK (1998-2001) ; Recruté INSERM (CR1) en 2001. Depuis 2008, DR2 INSERM.

Domaine d’expertise  
Physiologie cardiaque, biologie cellulaire, vieillissement, sénescence, insuffisance cardiaque.

CLINICIEN

Jacques AMAR

MD, Docteur en Médecine, Professeur des Universités Praticien Hospitalier

Carrière professionnelle
Habilitation à diriger la Recherche (2000) ; Professeur des Universités de Thérapeutique (2001) ; promotion à la première classe (2009), classe exceptionnelle (2015).

Domaines d’expertise
Microbiote tissulaire, Hypertension Artérielle, Diabète.

CLINICIEN

Vincent BLASCO-BAQUE

DMD, PhD, Maître de conference et praticien hospitalier 

Carrière professionnelle
DMD Doctorat d’état en Chirurgie-Dentaire (2009) ; PhD en Biologie, Santé, biotechnologies, spécialité Physiopathologie, directeur R.  Burcelin (2013) ; DIU d’Endodontie (2014) ; MCU-PH UFR Santé de Toulouse (2016) ; HDR (2019).

Domaines d’expertise
chirurgie-dentaire, microbiote oral, maladies métaboliques, parodontites et maladies parodontales, Porphyromonas ginigvalis.

Post-doctorante

Nathalie BOULET

PhD, Post-doctorante

Cheminement de carrière
Doctorat en Physiopathologie, Directeurs J Galitzky/A Bouloumié (2015) ; Post-Doc Laboratoire de J Nedergaard et B Cannon, Stockholm, Suède (2015-2018) ; Depuis 2018, post-doc, Equipe Bouloumié, I2MC, Toulouse.

Domaine d’expertise  
Cellules progénitrices, tissus adipeux blanc et brun, adipogenèse, myofibrogenèse, obésité, activité mitochondriale.

DOCTORANT

Alex AUPETIT

Doctorant

Carrière professionnelle
Master Biologie Santé option Physiologie, Physiopathologie et Pharmacologie, Université de Poitiers (2020) ;  Depuis Octobre 2020, doctorant sous la direction d’Anaïs Briot « Fonction métabolique de la microvasculature des tissus adipeux : une cible de l’obésité et du vieillissement », Equipe Bouloumié I2MC, Université Paul Sabatier, Toulouse, Financement INSERM/Région Occitanie.

Domaines d’expertise
Physiologie vasculaire, Tissu adipeux, vieillissement.

CLINICIEN - DOCTORANT

Matthieu MINTY

DMD, Assistant hospitalo-universitaire, Faculté chirurgie dentaire, Doctorant 

Carrière professionnelle
Diplôme de chirurgien-dentiste dans la faculté de chirurgie dentaire de Paul Sabatier (2017) ;  Master Biologie Santé option Physiopathologie des infections, Université de Paul Sabatier Toulouse (2019)  ; Depuis Sept 2020, Doctorant sous la direction de V Blasco « le microbiote oral : acteur majeur de notre santé générale », Equipe Burcelin, I2MC, Université Paul Sabatier, Toulouse.

Domaines d’expertise
chirurgie-dentaire, microbiote oral, maladies métaboliques, Porphyromonas ginigvalis.

CLINICIEN - DOCTORANT

Charlotte THOMAS

DDS, Assitante hospitalo-universitaire (Faculté de Chirurgie Dentaire), Doctorante

Carrière professionnelle
Diplôme de Chirurgien-dentiste, Faculté de Chirurgie Dentaire de Toulouse (2018) ; Internat 2015-2018  Diplôme d’Etat de Spécialité en Médecine Bucco-Dentaire, Faculté de Chirurgie Dentaire de Toulouse; 2019 Spécialisation en Parodontologie, Diplôme Universitaire, Université Paul Sabatier Toulouse; 2019 Master Biologie Santé : Physiopathologie du moléculaire au médical, Université  Paul Sabatier Toulouse (2019);
Depuis Sept 2019, Doctorante sous la direction du Dr Vincent Blasco-Baque et Dr Sara Laurencin-Dalicieux : “Microbiote oral et obésité : de la signature du microbiote oral dysbiotique chez l’Homme à la causalité chez la souris”, Université Paul Sabatier, Toulouse.

Domaines d’expertise
Chirurgie-dentaire, microbiote oral, parodontite, obésité.

Technicien de recherche

Vincent AZALBERT

Technicien de recherche INSERM

Cheminement de carrière
BTS ABM Analyse Biologie et médicale (2007-2009), recruté à l’INSERM depuis 2009.

Domaine d’expertise
Biologie moléculaire (Extraction ADN-ARN,PCR, RT-qPCR), Biologie Cellulaire (culture Cellules progénitrices tissu adipeux), Immunologie (marquage cellules Immunes, FACS, t-SNE), Biochimie (dosages ELISA)

Assitante Ingénieur

Pauline DECAUNES BESSEDE

Assistante Ingénieur INSERM

Carrière professionnelle
Licence professionnelle de Biotechnologies, Université Versailles- St Quentin en Yvelines, (2004) ; Assistante Ingénieur, INRA Jouy-en-Josas (2004-2006), INSERM Equipe AVENIR/Bouloumié, I2MR, Toulouse (2006-2009) ; TCN INSERM Equipe Bouloumié, I2MC, Toulouse (2010-2019) ; Depuis 2019, AI INSERM Team Bouloumié, I2MC.

Domaines d’expertise
Isolement et culture de cellules vasculaires et stromales humaines et murines par cytométrie en flux et/ou billes magnétiques ; Approches : Imagerie, analyses transcriptionnelles, protéiques et lipidiques.

Assitant Ingénieur

Albéric GERMAIN

 Assistant ingénieur

Cheminement de carrière
Master en Biologie, Écologie, Évolution, spécialité Modélisation en Système Écologique, Université Toulouse III (2015-2017) ; Assistant de recherche, Université Toulouse III, CRCA (2018) ; depuis 2020 Assistant Ingénieur, I2MC, Toulouse

Domaine d’expertise 
Analyse de données, Biostatistiques, données omiques.

Adjoint technique

Pascale LOUBIERES

Adjointe technique de recherche et Formation, Faculté de Chirurgie Dentaire De Toulouse

Carrière professionnelle
Brevet de technicien supérieur ANABIOTEC ITSA La Raque Lasbordes (1994) ; Depuis 1995 Adjoint technique de recherche et Formation, Université Paul Sabatier et depuis 2010 Equipe Burcelin, I2MC, Toulouse.

Domaines d’expertise
Microbiologie générale et buccale, experimentation animale, biologie moléculaire.

Ingénieur

Joao PIRAQUIVE

PhD, Ingénieur de recherche

Carrière professionnelle
Doctorat en Imagerie médicale, spécialité IRM préclinique, Université Paris Diderot (2018) ; Post-Doc Université de Californie San Francisco, UCSF, USA (2019-2021) ; Depuis juin 2021, Ingénieur de recherche CREFRE-ENI et I2MC, Toulouse.

Domaines d’expertise
MRI, MRI Agents de contraste, spectroscopie, Physique, inflammation

Assitante Ingénieur

Jiuwen SUN

Assistante Ingénieur INSERM

Carrière professionnelle
Master en Sciences et Technologie de l’agriculture de l’alimentation et de l’environnement parcours Biologie Intégrative (OMICS), Université Paris Est Créteil Val Sur Marne (2019-2021). Depuis Août 2021, AI INSERM Team Bouloumié, I2MC.

Domaines d’expertise
Analyse de données, Biostatistiques, données omiques.

PhD, IE, Responsable opérationnel du plateau de cytométrie

Alexia ZAKAROFF-GIRARD

PhD, Responsable opérationnel du plateau de cytométrie, Ingénieur

Alexia Zakaroff-Girard a obtenu son doctorat à l’Université Claude Bernard (Lyon) en 1997 où elle a étudié le rôle des phospholipides biologiquement actifs dans la réponse immunitaire. Elle a effectué un stage post-doctoral à l’I2MC en physiologie du tissu adipeux. Depuis 10 ans, elle dirige le service de cytométrie et de tri cellulaire de l’I2MC, offrant une grande expérience et des ressources dans l’utilisation de la cytométrie en flux pour l’analyse et le tri des populations cellulaires prélevées dans les tissus solides pour les chercheurs académiques et privés.

Principaux domaines d’expertise :
Cytométrie en flux, tri cellulaire, physiologie du tissu adipeux, biologie cellulaire.

Dysbiose microbienne, hétérogénéité des dépôts adipeux et dysfonction cardiométabolique

 

Coordinateurs : Vincent Blasco-Baque, Xavier Collet, Rémy Burcelin

Nos objectifs sont la création et l’analyse de banques de données larges échelles (métagénomiques, transcriptomiques, métabolomiques) de dépôts adipeux et de microbiomes tissulaires et buccaux issus de cohortes humaines et murines (dont des lignés de souris axéniques colonisées par des microbiotes humains) dans des contextes d’obésité et de vieillissement en fonction du sexe. Les liens avec les données cliniques/biologiques sont analysés par des stratégies « machine learning » (développement de nouveaux algorithmes) afin d’extraire l’information classifiant et/ou prédictive des phénotypes cardiométaboliques et de proposer de nouvelles relations moléculaires entre les bactéries tissulaires et les cellules des dépôts adipeux.

Fonction métabolique de l’endothélium microvasculaire: hétérogénéité, detection et gestion des nutriments

 

Coordinatrices : Anaïs Briot, Anne Bouloumié

Nos travaux sur les cellules endothéliales microvasculaires natives et primaires des dépôts adipeux sous-cutanés et viscéraux humains et murins visent à 1) identifier les mécanismes cellulaires et moléculaires mis en jeu dans la détection et le transport des nutriments, 2) cartographier les sous-populations endothéliales contribuant à la gestion des flux métaboliques et 3) évaluer l’impact de l’obésité et du vieillissement sur la fonction métabolique de la vasculature des dépôts adipeux humains et murins.

Des cellules progénitrices vers les adipocytes matures : Hétérogénéité, différenciation et fonction

 

Coordinateurs : Jean Galitzky, Christian Carpéné, Anne Bouloumié

Nos objectifs sont de définir le rôle des bacteries et de leurs dérivés dans les mécanismes moléculaires intrinsèques et extrinsèques gouvernant l’hétérogénéité 1) des cellules progénitrices en terme de leur devenir adipogenique (blanc, beige et brun) et myofibrogenique et de leur localisation intra-lobule et inter-dépôts et 2) fonctionnelle adipocytaire.

Dynamique et adaptation de l’axe microbiote/dépôts adipeux:

Flexibilité métabolique et jeûne

 

Coordinatrice : Anaïs Briot

A l’aide de différents protocoles de jeûne, nos objectifs sont 1) d’identifier des combinaisons dynamiques de marqueurs (métabolomique, transcriptomique et métagénomique) de l’inflexibilité métabolique, 2) d’évaluer les conséquences bénéfiques et délétères sur le phénotype et la fonctionnalité des cellules des dépôts adipeux et 3) d’identifier des mécanismes cellulaires et moléculaires reproduisant de manière sélective les effets bénéfiques du jeûne intermittent en fonction du sexe, de l’âge et de la santé métabolique.

Dynamique et adaptation de l’axe microbiote/dépôts adipeux:

Flexibilité métabolique et PRE-PROBIOTIQUE

 

Coordinateur : Christophe Heymes

A l’aide d’une approche nutritionnelle (basée sur l’utilisation d’un prébiotique), les objectifs au cours du développement de l’obésité/diabète, sont 1) d’étudier les dysbioses intestinale et tissulaires (tissus adipeux et cœur) ; 2)  d’étudier les effets du Polydextrose (prébiotique) sur ces dysbioses et l’impact sur la dysfonction cardiaque ; 3) d’identifier de nouveaux probiotiques et métabolites bactériens responsables des effets observés ; 4) d’identifier des mécanismes moléculaires (peptides, protéines sécrétes par l’intestin et/ou le tissu adipeux) médiant en partie les effets observés.

publications RECENTES

Obesity of mice lacking VAP-1/SSAO by Aoc3 gene deletion is reproduced in mice expressing a mutated vascular adhesion protein-1 (VAP-1) devoid of amine oxidase activity, Jargaud V, Bour S, Tercé F, Collet X, Valet P, Bouloumié A, Guillemot JC, Mauriège P, Jalkanen S, Stolen C, Salmi M, Smith DJ, Carpéné C. J Physiol Biochem. 2021. Pubmed

Detection of representative variables in complex systems wtih interpretable rules using Core-Clusters. Champion, C., A. C. Brunet, R. Burcelin, J. M. loubes and l. Risser. Algorithms 2021. Pubmed

Molecular phenomics and metagenomics of hepatic steatosis in non-diabetic obese women. Hoyles, L., J. M. Fernandez-Real, M. Federici, M. Serino, J. Abbott, J. Charpentier, C. Heymes, J. L. Luque, E. Anthony, R. H. Barton, J. Chilloux, A. Myridakis, L. Martinez-Gili, J. M. Moreno-Navarrete, F. Benhamed, V. Azalbert, V. Blasco-Baque, J. Puig, G. Xifra, W. Ricart, C. Tomlinson, M. Woodbridge, M. Cardellini, F. Davato, I. Cardolini, O. Porzio, P. Gentileschi, F. Lopez, F. Foufelle, S. A. Butcher, E. Holmes, J. K. Nicholson, C. Postic, R. Burcelin and M. E. Dumas. Nat Med. 2018. Pubmed

Lobular architecture of human adipose tissue defines the niche and fate of progenitor cells. Estève D, Boulet N, Belles C, Zakaroff-Girard A, Decaunes P, Briot A, Veeranagouda Y, Didier M, Remaury A, Guillemot JC, Ledoux S, Dani C, Bouloumié A, Galitzky J. Nat Commun. 2019. Pubmed

Senescence Alters PPARγ (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma)-Dependent Fatty Acid Handling in Human Adipose Tissue Microvascular Endothelial Cells and Favors Inflammation. Briot A, Decaunes P, Volat F, Belles C, Coupaye M, Ledoux S, Bouloumié A. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2018Pubmed

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