équipe A. Bouloumié / R. Burcelin
DINAMIX: Tissu adipeux, microbiote et flexibilité cardiométabolique
Notre recherche propose une approche intégrée et pluridisciplinaire des mécanismes d’adaptation métabolique dans le contexte du vieillissement naturel et accéléré par l’obésité/diabète, basée sur le concept original du rôle déterminant de l’axe microbiote/dépôts adipeux dans la flexibilité cardio-métabolique.
L’Équipe
Anne BOULOUMIE-DIEHL
Rémy BURCELIN
Anaïs BRIOT
Christian CARPENE
Xavier COLLET
Jean GALITZKY
Christophe HEYMES
Jacques AMAR
Vincent BLASCO-BAQUE
Nathalie BOULET
Alex AUPETIT
Matthieu MINTY
Charlotte THOMAS
Vincent AZALBERT
Pauline DECAUNES BESSEDE
Albéric GERMAIN
Pascale LOUBIERES
Joao PIRAQUIVE
Jiuwen SUN
Alexia ZAKAROFF-GIRARD
Dysbiose microbienne, hétérogénéité des dépôts adipeux et dysfonction cardiométabolique
Coordinateurs : Vincent Blasco-Baque, Xavier Collet, Rémy Burcelin
Nos objectifs sont la création et l’analyse de banques de données larges échelles (métagénomiques, transcriptomiques, métabolomiques) de dépôts adipeux et de microbiomes tissulaires et buccaux issus de cohortes humaines et murines (dont des lignés de souris axéniques colonisées par des microbiotes humains) dans des contextes d’obésité et de vieillissement en fonction du sexe. Les liens avec les données cliniques/biologiques sont analysés par des stratégies « machine learning » (développement de nouveaux algorithmes) afin d’extraire l’information classifiant et/ou prédictive des phénotypes cardiométaboliques et de proposer de nouvelles relations moléculaires entre les bactéries tissulaires et les cellules des dépôts adipeux.
Fonction métabolique de l’endothélium microvasculaire: hétérogénéité, detection et gestion des nutriments
Coordinatrices : Anaïs Briot, Anne Bouloumié
Nos travaux sur les cellules endothéliales microvasculaires natives et primaires des dépôts adipeux sous-cutanés et viscéraux humains et murins visent à 1) identifier les mécanismes cellulaires et moléculaires mis en jeu dans la détection et le transport des nutriments, 2) cartographier les sous-populations endothéliales contribuant à la gestion des flux métaboliques et 3) évaluer l’impact de l’obésité et du vieillissement sur la fonction métabolique de la vasculature des dépôts adipeux humains et murins.
Des cellules progénitrices vers les adipocytes matures : Hétérogénéité, différenciation et fonction
Coordinateurs : Jean Galitzky, Christian Carpéné, Anne Bouloumié
Nos objectifs sont de définir le rôle des bacteries et de leurs dérivés dans les mécanismes moléculaires intrinsèques et extrinsèques gouvernant l’hétérogénéité 1) des cellules progénitrices en terme de leur devenir adipogenique (blanc, beige et brun) et myofibrogenique et de leur localisation intra-lobule et inter-dépôts et 2) fonctionnelle adipocytaire.
Dynamique et adaptation de l’axe microbiote/dépôts adipeux:
Flexibilité métabolique et jeûne
Coordinatrice : Anaïs Briot
A l’aide de différents protocoles de jeûne, nos objectifs sont 1) d’identifier des combinaisons dynamiques de marqueurs (métabolomique, transcriptomique et métagénomique) de l’inflexibilité métabolique, 2) d’évaluer les conséquences bénéfiques et délétères sur le phénotype et la fonctionnalité des cellules des dépôts adipeux et 3) d’identifier des mécanismes cellulaires et moléculaires reproduisant de manière sélective les effets bénéfiques du jeûne intermittent en fonction du sexe, de l’âge et de la santé métabolique.
Dynamique et adaptation de l’axe microbiote/dépôts adipeux:
Flexibilité métabolique et PRE-PROBIOTIQUE
Coordinateur : Christophe Heymes
A l’aide d’une approche nutritionnelle (basée sur l’utilisation d’un prébiotique), les objectifs au cours du développement de l’obésité/diabète, sont 1) d’étudier les dysbioses intestinale et tissulaires (tissus adipeux et cœur) ; 2) d’étudier les effets du Polydextrose (prébiotique) sur ces dysbioses et l’impact sur la dysfonction cardiaque ; 3) d’identifier de nouveaux probiotiques et métabolites bactériens responsables des effets observés ; 4) d’identifier des mécanismes moléculaires (peptides, protéines sécrétes par l’intestin et/ou le tissu adipeux) médiant en partie les effets observés.
publications RECENTES
Obesity of mice lacking VAP-1/SSAO by Aoc3 gene deletion is reproduced in mice expressing a mutated vascular adhesion protein-1 (VAP-1) devoid of amine oxidase activity, Jargaud V, Bour S, Tercé F, Collet X, Valet P, Bouloumié A, Guillemot JC, Mauriège P, Jalkanen S, Stolen C, Salmi M, Smith DJ, Carpéné C. J Physiol Biochem. 2021. Pubmed
Detection of representative variables in complex systems wtih interpretable rules using Core-Clusters. Champion, C., A. C. Brunet, R. Burcelin, J. M. loubes and l. Risser. Algorithms 2021. Pubmed
Molecular phenomics and metagenomics of hepatic steatosis in non-diabetic obese women. Hoyles, L., J. M. Fernandez-Real, M. Federici, M. Serino, J. Abbott, J. Charpentier, C. Heymes, J. L. Luque, E. Anthony, R. H. Barton, J. Chilloux, A. Myridakis, L. Martinez-Gili, J. M. Moreno-Navarrete, F. Benhamed, V. Azalbert, V. Blasco-Baque, J. Puig, G. Xifra, W. Ricart, C. Tomlinson, M. Woodbridge, M. Cardellini, F. Davato, I. Cardolini, O. Porzio, P. Gentileschi, F. Lopez, F. Foufelle, S. A. Butcher, E. Holmes, J. K. Nicholson, C. Postic, R. Burcelin and M. E. Dumas. Nat Med. 2018. Pubmed
Lobular architecture of human adipose tissue defines the niche and fate of progenitor cells. Estève D, Boulet N, Belles C, Zakaroff-Girard A, Decaunes P, Briot A, Veeranagouda Y, Didier M, Remaury A, Guillemot JC, Ledoux S, Dani C, Bouloumié A, Galitzky J. Nat Commun. 2019. Pubmed
Senescence Alters PPARγ (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma)-Dependent Fatty Acid Handling in Human Adipose Tissue Microvascular Endothelial Cells and Favors Inflammation. Briot A, Decaunes P, Volat F, Belles C, Coupaye M, Ledoux S, Bouloumié A. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2018. Pubmed
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