Membres de l'équipe

Responsable(s) plateau
Flores-Flores
Rémy
(IE INSERM)

Flores-Flores Rémy (IE INSERM)

imagerie.i2mc@inserm.fr

05 31 22 41 63

Membre(s) du plateau
D'Angelo
Romina
(IE INSERM)

D'Angelo Romina (IE INSERM)

imagerie.i2mc@inserm.fr

05.61.32.56.45

Ingénieur d'étude INSERM




Comité scientifique
Ramel
Damien

Ramel Damien

Boal
Frédéric

Boal Frédéric

imagerie.i2mc@inserm.fr

05.31.22.41.63

Ingénieur d'étude plateau (CDD)
Bourlier
Virginie

Bourlier Virginie

Buscato
Melissa

Buscato Melissa

Clerc
Pascal

Clerc Pascal

Galitzky
Jean

Galitzky Jean

Mazars
Anne

Mazars Anne

Séverin
Sonia

Séverin Sonia

Tatin
Florence

Tatin Florence

En tête logos 4
Le plateau d'imagerie cellulaire de l'I2MC est localisé sur le site Rangueil (Bâtiment L3, CHU Rangueil), et  rattaché à la plateforme TRI (Toulouse Réseau Imagerie) du Genotoul. Le plateau technique est ouvert à toute la communauté scientifique dans le respect de la Charte IBiSA ; il est certifiée ISO 9001/version 2008 depuis janvier 2010, NF-X 50-900 depuis 2013.
 
Le plateau est membre du RTmFm, Réseau Technologique de Microscopie photonique de Fluorescence Multidimensionnelle, ainsi que du IMABIO*, le nouveau GDR remplaçant le GDR MIV 2588 en Microscopie et Imagerie du Vivant.

 Modalités d'accès  

Documents d'accès, Règlements : Règlement interne plateau, annexe règlement-accès, règlement TRI

TarifsFormules de remerciements - Logos

Les personnes souhaitant utiliser le plateau doivent :

  1.  envoyer un mail de demande à : imagerie.i2mc@inserm.fr
  2.  prendre rendez-vous avec le personnel du plateau afin d'étudier leur besoin; l'ingénieur plateau oriente le demandeur vers la solution d'imagerie la plus appropriée
  3. prendre connaissance de tous les règlements, et remplir la fiche de demande de prestations. Ces documents doivent être signés par chaque utilisateur et retournés au plateau lors du premier rendez-vous.

En cas de formation, un rendez-vous est pris pour une ou deux sessions à l'issu desquelles l'utilisateur est validé sur l'appareil et peut gérer en autonomie ses réservations.

Une assistance pour l'acquisition d'images est fournie sur rendez-vous tous les jours. Sur les machines très surchargées (confocaux), n'hésitez pas à prendre contact au moins deux semaines à l'avance pour toute demande.

Sur demande, le traitement des images (calibration, annotations, quantification de fluorescence, reconstruction 3D ou 4D, déconvolution, tracking...) peut faire l'objet d'une formation ou d'une collaboration avec le plateau technique. Il en est de même pour la mise au point et le développement des F-Techniques (FRET, FLIP, FRAP...).

Matériels et Ressources   materiels ressources

Microscopes Confocaux :  ZEISS  LSM 780-Airyscan 1; LSM 900- Fast Airyscan 2
Champ Large : vidéo-microscope Zeiss Cell-Observer

Super-résolution : Zeiss ELYRA PS. 1


Nouveauté Octobre 2020

Confocal ZEISS LSM 900 avec Airyscan 2 /Imagerie multiplex

Ce Microscope inversé est équipé de :

4 Sources d'excitation lasers: 405 nm, 488, 561nm , 640 nm

3 détecteurs : GaAasP-PMT dont 1 détecteur Airyscan

3 objectifs : 5x 0.15 ; 20x 0.8 ; 63x 1.3 oil

3 supports dont un porte 4 lames

 photo Rémy LSM9003 supportsLSM900

Applications spécifiques du LSM900

Grâce au détecteur Airyscan Multiplex, sont une amélioration de :

   la résolution et de la sensibilité

   la vitesse d’acquisition en mode multiplex

Grâce au logiciel d’acquisition ZEN Blue, de nombreuses possibilités et combinaisons permettant par exemple :

   Preview de la lame

   Mosaïque avec points de référence (pour les coupes de tissu)

   FRAP/activation à la volée

Une caméra couleur permet de faire des Preview plus rapides, et acquisition en lumière transmise.

Airyscan Multiplex : résolution et vitesse

Airyscan Multiplex LSM9008SITE

Confocal Microscope Zeiss LSM 780 + Module Airyscan (plus d'info)

Le Microscope inversé Zeiss Observer Z1, est équipé de trois types de sources d'excitation lasers: Diode 405 nm, Argon (458, 488, 514nm), DPSS : 561nm et HeNe 633 nm. Un détecteur GaAsp très sensible avec un rendement quantique allant jusqu'à 45% pour une plage de longueur d'onde spécifique, et une détection spectrale parallèle allant jusqu'à 34 canaux simultanément en mode lambda. Cet appareil  possède également un module FCS (Fluorescence Correlation Spectrometry) et une possibilité d'exploration avec les F-Techniques (FRET, FRAP etc.). L'appareil est encagé pour un contrôle environnemental en température et CO2 permettant de faire des acquisitions sur cellules vivantes. Tous les supports de cultures peuvent être montés (chambre Ibidi 35 mm, format Labtek, etc....)
Il est piloté par le logiciel ZEN 2012 édition black, ayant des applications avancées (Reconstructions de volumes 3D, projections, quantification, colocalisation...). Le détecteur spectral intégré offre la possibilité d'imager en parallèle jusqu'à 8 couleurs sur un même échantillon, en changeant les paramètres en x/y/z, et en faisant également des images en mode mosaïque (jusqu'à 5 dimensions peuvent donc être intégrées en temps réel).

Le module Airyscan installé en mars 2017 permet d'accéder à la haute résolution (plus d'info)

LSM780

 

Station de vidéo-microscopie Champ Large Zeiss Cell-Observer

Le vidéo-microscope inversé Zeiss Cell Observer Z1, est équipé d'une chambre thermo-régulée et un module de CO2 qui offrent un environnement de travail adapté au fixé et au vivant.
- Deux caméras Hamamatsu, ORCA R² et une EM-CCD permettent de privilégier selon l'application la qualité d'image ou la rapidité respectivement. Il offre une large gamme d'expériences, notamment grâce aux choix des objectifs présents (longue distance de travail) et filtres d'excitation et d'émission.
- Deux sources d'illumination :
1. rapide (COLIBRI LED system) permettant de changer les longueurs d'ondes d'excitation très rapidement. 4 longueurs d'ondes disponibles: Green (GFP), Red (CY3), Blue (DAPI), far Red (CY5)
2. Autre longueurs d'ondes possibles en utilisant la source HXP et des filtres d'émission sur roues rapides. Il est également équipé pour le FRET en CFP/YFP.
L'appareil est également utilisé pour des expériences de microfluidique sur différents supports (Cellix, Ibidi, support pour plaque Bioflux).
Cette configuration permet des investigations sur cellules vivantes à des temps très rapides (quelques secondes pour la formation de thrombi plaquettaires en flux) et sur longue durée (jusqu'à 1 semaine d'observation possible). Le système est adapté pour une multiplicité de supports (fonds en plastique et verre, boites, multiwells, Labtek etc)
Il est piloté par le logiciel ZEN  2012 édition blue, avec des modules d'acquisition et de traitement optimisés. Il est possible de réaliser des acquisitions en Multi-positions, mosaiques, et Z stacks en même temps. L'intégration du module « definite focus » permet un maintien de la stabilité en multiposition sur des temps longs.

cell observer
 

Microscopie Super-résolution Zeiss ELYRA PS. 1

Le plateau sera équipé courant premier semestre 2015 d'un système Zeiss ELYRA PS-1. Cet appareil permet d'explorer en parallèle sur un même échantillon des structures subcellulaire en super-résolution selon différents modes :
- technologie SR-SIM : la « structured illumination microscopy » permet d'obtenir des résolutions de l'ordre de 100 nm, en trois couleurs (utilisation de fluorophores et protéines fluorescentes classiques, compatibles avec l'imagerie de la cellule vivante) et en 3D.
- technologie PALM/STORM : la « photo-activated localization microscopy » permet de descendre la résolution à quelques dizaines de nm en utilisant des fluorophores ou des protéines fluorescentes pho-activables. La « stochastic optical reconstruction microscopy » permet d'obtenir des résolutions allant jusqu'à la molécule unique.
Le microscope permettra des analyses en 3D, ainsi que la possibilité unique de passer de l'une à l'autre des technologies sur les mêmes échantillons en utilisant les fluorophores adéquats.

 elyra super res