Membres de l'équipe

Responsable(s) plateau
Gaits-Iacovoni
Frédérique
(DR CNRS)

Gaits-Iacovoni Frédérique (DR CNRS)

Frederique.Gaits@inserm.fr

05.61.32.41.51

Membre(s) du plateau
D'Angelo
Romina
(IE INSERM)

D'Angelo Romina (IE INSERM)

imagerie.i2mc@inserm.fr

05.61.32.56.45

Ingénieur d'étude INSERM




Véga
Elodie
(IE CDD)

Véga Elodie (IE CDD)

imagerie.i2mc@inserm.fr

05.31.22.41.63

Ingénieur d'étude plateau (CDD)
Michel
Déborah
(IE vac)

Michel Déborah (IE vac)

imagerie.i2mc@inserm.fr

05 31 22 41 63

Ingénieur plateau (vacation)
En tête logos 4
Le plateau d'imagerie cellulaire de l'I2MC est localisé sur le site Rangueil (Bâtiment L3, CHU Rangueil), et  rattaché à la plateforme TRI (Toulouse Réseau Imagerie) du Genotoul. Le plateau technique est ouvert à toute la communauté scientifique dans le respect de la Charte IBiSA ; il est certifiée ISO 9001/version 2008 depuis janvier 2010, NF-X 50-900 depuis 2013.
 
Le plateau est membre du RTmFm, Réseau Technologique de Microscopie photonique de Fluorescence Multidimensionnelle, ainsi que du IMABIO*, le nouveau GDR remplaçant le GDR MIV 2588 en Microscopie et Imagerie du Vivant.

 

Modalités d'accès  

·         Documents d'accès, Règlements : Règlement interne plateau, annexe règlement-accès, règlement TRI

·         Tarifs, Formules de remerciements - Logos

 

Les personnes souhaitant utiliser le plateau doivent :

  1.       envoyer un mail de demande à : imagerie.i2mc@inserm.fr
  2.       prendre rendez-vous avec le personnel du plateau afin d'étudier leur besoin; l'ingénieur plateau oriente le demandeur vers la solution d'imagerie la plus appropriée selon la procédure formalisée d'accès
  3.      prendre connaissance de tous les règlements, et remplir la fiche de demande de prestations. Ces documents doivent être signés par chaque utilisateur et retournés au plateau lors du premier rendez-vous.

En cas de formation, un rendez-vous est pris pour 2 sessions de deux heures à l'issu desquelles l'utilisateur est validé sur l'appareil et peut gérer en autonomie ses réservations.

Une assistance pour l'acquisition d'images est fournie sur rendez-vous tous les jours. Sur les machines très surchargées (confocal 780), n'hésitez pas à prendre contact au moins deux semaines à l'avance pour toute demande.

Sur demande, le traitement des images (calibration, annotations, quantification de fluorescence, reconstruction 3D ou 4D, déconvolution, tracking...) peut faire l'objet d'une formation ou d'une collaboration avec le plateau technique. Il en est de même pour la mise au point et le développement des F-Techniques (FRET, FLIP, FRAP...).

Matériels et Ressources   materiels ressources


  • Microscopes Confocaux :  ZEISS LSM 510; LSM 780 avec module AiryScan
  • Champ Large : vidéo-microscope Zeiss Cell-Observer
  • Microscopie Super-résolution : Zeiss ELYRA PS. 1

Microscope Confocal ZEISS LSM 510

Le Microscope Confocal ZEISS LSM 510 est équipé de 3 lasers dans le visible (un laser argon multi-raies à 458 nm, 477 nm, 488 nm, et 514 nm, et deux lasers hélium-néon à 543 nm et 633 nm), sur statif inversé. Les objectifs présents sont un 10X et 25x pour l'observation globale, un 40X à haute résolution pour l'observation sub-cellulaire.
La possibilité de thermorégulation de la préparation permet l'acquisition d'échantillons vivants. Le module FCS Confocor-2 offre la possibilité de mesurer des interactions moléculaires au sein des cellules vivantes. Le traitement d'image est fait soit sous le logiciel ZEISS LSM, soit sous le logiciel gratuit Image J.

LSM510

 

Station de vidéo-microscopie Champ Large Zeiss Cell-Observer

Le vidéo-microscope inversé Zeiss Cell Observer Z1, est équipé d'une chambre thermo-régulée et un module de CO2 qui offrent un environnement de travail adapté au fixé et au vivant.
- Deux caméras Hamamatsu, ORCA R² et une EM-CCD permettent de privilégier selon l'application la qualité d'image ou la rapidité respectivement. Il offre une large gamme d'expériences, notamment grâce aux choix des objectifs présents (longue distance de travail) et filtres d'excitation et d'émission.
- Deux sources d'illumination :
1. rapide (COLIBRI LED system) permettant de changer les longueurs d'ondes d'excitation très rapidement. 4 longueurs d'ondes disponibles: Green (GFP), Red (CY3), Blue (DAPI), far Red (CY5)
2. Autre longueurs d'ondes possibles en utilisant la source HXP et des filtres d'émission sur roues rapides. Il est également équipé pour le FRET en CFP/YFP.
L'appareil est également utilisé pour des expériences de microfluidique sur différents supports (Cellix, Ibidi, support pour plaque Bioflux).
Cette configuration permet des investigations sur cellules vivantes à des temps très rapides (quelques secondes pour la formation de thrombi plaquettaires en flux) et sur longue durée (jusqu'à 1 semaine d'observation possible). Le système est adapté pour une multiplicité de supports (fonds en plastique et verre, boites, multiwells, Labtek etc)
Il est piloté par le logiciel ZEN  2012 édition blue, avec des modules d'acquisition et de traitement optimisés. Il est possible de réaliser des acquisitions en Multi-positions, mosaiques, et Z stacks en même temps. L'intégration du module « definite focus » permet un maintien de la stabilité en multiposition sur des temps longs.

cell observer

Confocal Microscope Zeiss LSM 780

Le Microscope inversé Zeiss Observer Z1, est équipé de trois types de sources d'excitation lasers: Diode 405 nm, Argon (458, 488, 514nm), DPSS : 561nm et HeNe 633 nm. Un détecteur GaAsp très sensible avec un rendement quantique allant jusqu'à 45% pour une plage de longueur d'onde spécifique, et une détection spectrale parallèle allant jusqu'à 34 canaux simultanément en mode lambda. Cet appareil  possède également un module FCS (Fluorescence Correlation Spectrometry) et une possibilité d'exploration avec les F-Techniques (FRET, FRAP etc.). L'appareil est encagé pour un contrôle environnemental en température et CO2 permettant de faire des acquisitions sur cellules vivantes. Tous les supports de cultures peuvent être montés (chambre Ibidi 35 mm, format Labtek, etc....)
Il est piloté par le logiciel ZEN 2012 édition black, ayant des applications avancées (Reconstructions de volumes 3D, projections, quantification, colocalisation...). Le détecteur spectral intégré offre la possibilité d'imager en parallèle jusqu'à 8 couleurs sur un même échantillon, en changeant les paramètres en x/y/z, et en faisant également des images en mode mosaïque (jusqu'à 5 dimensions peuvent donc être intégrées en temps réel).

Le module Airyscan installé en mars 2017 permet d'accéder à la haute résolution (plus d'info).

LSM780

 

Microscopie Super-résolution Zeiss ELYRA PS. 1

Le plateau sera équipé courant premier semestre 2015 d'un système Zeiss ELYRA PS-1. Cet appareil permet d'explorer en parallèle sur un même échantillon des structures subcellulaire en super-résolution selon différents modes :
- technologie SR-SIM : la « structured illumination microscopy » permet d'obtenir des résolutions de l'ordre de 100 nm, en trois couleurs (utilisation de fluorophores et protéines fluorescentes classiques, compatibles avec l'imagerie de la cellule vivante) et en 3D.
- technologie PALM/STORM : la « photo-activated localization microscopy » permet de descendre la résolution à quelques dizaines de nm en utilisant des fluorophores ou des protéines fluorescentes pho-activables. La « stochastic optical reconstruction microscopy » permet d'obtenir des résolutions allant jusqu'à la molécule unique.
Le microscope permettra des analyses en 3D, ainsi que la possibilité unique de passer de l'une à l'autre des technologies sur les mêmes échantillons en utilisant les fluorophores adéquats.

 elyra super res